Отдел международных связей Ургенчского государственного университета был создан в 2000 году. В разные годы должность начальника отдела занимали: Б. Хикметов (2000–2002 гг.), З. Ибрагимов (2002–2007 гг., с августа 2015 г.), М. Машарипов (2007–2009 гг.), Ж. Болтаев (2009–2012 гг.), Л. Ганджаева (2013 г.), Р. Атаханов (2012 г., 2014–2015 гг.).

За прошедшие 15 лет отделом налажено сотрудничество с рядом стран, включая государства Европейского союза, США, Индию, Республику Корея, Малайзию, а также с такими международными организациями, как Организация Объединённых Наций, Агентство по образованию и культуре Европейской комиссии и другими, в области образования, научных исследований и обмена опытом.

В результате данного сотрудничества на сегодняшний день в университете реализовано более 30 крупных и малых проектов общей стоимостью около 15 миллионов долларов США. Более 200 профессоров-преподавателей, научных сотрудников и студентов прошли стажировки, повысили квалификацию и обучались в университетах и научных центрах развитых стран.

Кроме того, университет посетили более 100 высокопоставленных иностранных гостей (послы, ректоры университетов, государственные деятели, писатели и поэты), а также учёные, преподаватели, исследователи, волонтёры, студенты и сотрудники партнёрских организаций.

Следует особо отметить сотрудничество с такими организациями, как ЮНЕСКО и Программа развития ООН, программы Европейского союза TEMPUS, Erasmus Mundus и Erasmus+, организация KOICA (Корейское агентство международного сотрудничества), германские организации DAAD (Германская служба академических обменов) и GIZ (Германское общество международного сотрудничества), а также посольства и культурные центры США, Франции и Германии в Узбекистане.

В соответствии с меморандумом о сотрудничестве с Калифорнийским государственным университетом (США), 20–23 мая 2014 года в городе Фуллертон совместно с учёными данного университета была проведена первая международная конференция учёных США и Узбекистана, что позволило вывести сотрудничество между университетами на более высокий уровень. Было достигнуто соглашение о проведении данной конференции в 2017 году в Ургенчском государственном университете.

Кроме того, учёные двух университетов совместно представили в Национальный научный фонд США (National Science Foundation) проект, предусматривающий проведение научных исследований американскими студентами в период летних каникул совместно с учёными Ургенчского государственного университета, а также изучение истории Узбекистана.

В настоящее время университет в рамках программы Erasmus+ Европейского союза (направление «International Credit Mobility») сотрудничает с университетами Лас-Пальмас (Испания), Падуи (Италия), Латвийским университетом (Латвия) и Загребским университетом (Хорватия).

Кроме того, в рамках направления «Capacity Building» программы Erasmus+ осуществляется сотрудничество с Университетом Сантьяго-де-Компостела (Испания) по проекту «Establishment of Computing Centers and Curriculum Development in Mathematical Engineering Master program (ECCUM)».

В дальнейшем отдел международных связей планирует расширение масштаба и географии международного сотрудничества университета.